(Shtë (Yuuki Homura)

Në të ardhmen e afërt, një shkencëtar japonez inxhinieron një ekoskelet skeletor të quajtur "Stratos Infinite" (IS). Duke zotëruar teknologji dhe aftësi luftarake shumë më të përparuara se çdo sistem tjetër armësh, IS kërcënon të destabilizojë botën. Të ballafaquar me një armë kaq mbizotëruese, kombet e botës miratojnë "Traktatin e Alaskës", i cili thotë se IS nuk do të përdoret kurrë për luftime ushtarake dhe se teknologjia ekzistuese e IS duhet të shpërndahet në mënyrë të barabartë për të gjitha kombet, për të parandaluar që një komb të dominojë te tjeret. Futja e IS ka sidoqoftë një efekt të madh në shoqëri. Ndërsa IS mund të operohet vetëm nga gratë, ekuilibri i fuqisë midis burrave dhe grave është prishur, me gratë që vijnë për të dominuar shoqërinë mbi burrat.
Dhjetë vjet pas prezantimit të IS-së së parë, bota ka hyrë në një epokë të re paqeje. Paqja është copëtuar, megjithatë, nga një zbulim i papritur. Një djalë 15 vjeçar japonez, i quajtur Ichika Orimura, është zbuluar se është i aftë të operojë një IS. Duke kuptuar potencialin, Ichika detyrohet nga qeveria japoneze të marrë pjesë në Akademinë prestigjioze Infinite Stratos, një akademi ndërkombëtare ku trajnohen pilotët e IS nga e gjithë bota. Kështu fillon jeta e tij e ngjeshur shkollore e rrethuar nga vajzat.